Alle kender Cirkeline – den animerede alf og hendes hæse musevenner Ingolf og Frederik. I generationer er de blevet set og nydt af landets børn (og voksne). Men det er de færreste, der ved, hvem der egentlig opfandt Cirkeline. Kvinden bag er tegneren Hanne Hastrup og som mange andre kvinder i verdenshistorien mistede hun sin plads i rampelyset til fordel for en mand. Hendes egen mand, Jannik Hastrup, filmmanden og animatoren, var ham, som blev kendt for Cirkeline. Som helt unge mødte de hinanden og blev forelskede og begyndte at samarbejde om at lave de nu kendte Cirkelinefilm. I Cirkeline & den usynlige tegner fortæller de historien om tilblivelsen af ikonet i den røde kjole med de sorte prikker. Filmen er en personlig fortælling om Hanne Hastrups kunstneriske rejse og hvordan Hanne Hastrup opfandt det fantasifulde univers ud af nødvendighed. Det er en rørende historie om kærligheden mellem to kreative, idealistiske unge mennesker i begyndelsen af 1960erne, der var imod borgerskabet og som insisterede på at gøre tingene på deres egen måde. Og så er det ikke mindst en ‘coming-of-artist’-historie om en kvinde, der nu endelig får sin velfortjente plads i rampelyset.